Предприниматель выводит и тратит свой личный доход сразу и как хочет (может распоряжаться средствами на расчетном счету, как угодно, уплатив налог 6% или 15%)

Учредители ООО платят 13% с дивидендов т. е. с любой прибыли личной. У ИП такого налога нет. Получается у организаций нагрузка в любом случае + 13%. Кроме того, снятие денег с расчетного счета (а иметь его обязательно для ООО) всегда должно быть отражено в бухучете.

Разница между ИП и самозанятыми есть. Отличия И П от самозанятых граждан в процедуре регистрации, в ставке налога, в порядке декларирования дохода и уплаты налога.
Работать самозанятым гораздо проще в плане отчетности и уплаты налогов. Однозначно самозанятые платят меньше налогов (или по крайней мере столько же, сколько
ИП- спецрежимники). И самозанятым не надо применять ККТ.
Но, во-первых, есть ограничения на работу самозанятыми. А во-вторых, у самозанятых не идет пенсионный стаж.

Государственная регистрация юридического лица, местом нахождения которого является место жительства учредителя (доля УК которого 50 и более %), не запрещена.
Регистрация организации по адресу жилого объекта недвижимости допустима только в тех случаях, когда собственник объекта дал на это согласие.

Да, средства, внесенные в уставный капитал можно потратить. При использовании средств подразумевается, что установленный размер УК организации не изменяется. Тратится не сам уставный капитал, а средства, внесенные в счет его оплаты. В силу п. 4 ст. 15 ФЗ № 14 можно также использовать имущество, которым оплачены доли участников.